Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
KLHL28Q9NXS3 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms