Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD8

TMEM248, Transmembrane protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248Q9NWD8 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms