Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC6

MED17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED17Q9NVC6 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms