Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRY4

ARHGAP35, Rho GTPase-activating protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP35Q9NRY4 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ARHGAP35Q9NRY4 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ARHGAP35Q9NRY4 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ARHGAP35Q9NRY4 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ARHGAP35Q9NRY4 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ARHGAP35Q9NRY4 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ARHGAP35Q9NRY4 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ARHGAP35Q9NRY4 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ARHGAP35Q9NRY4 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ARHGAP35Q9NRY4 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ARHGAP35Q9NRY4 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ARHGAP35Q9NRY4 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ARHGAP35Q9NRY4 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ARHGAP35Q9NRY4 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ARHGAP35Q9NRY4 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
ARHGAP35Q9NRY4 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ARHGAP35Q9NRY4 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ARHGAP35Q9NRY4 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ARHGAP35Q9NRY4 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ARHGAP35Q9NRY4 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
ARHGAP35Q9NRY4 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
ARHGAP35Q9NRY4 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
ARHGAP35Q9NRY4 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
ARHGAP35Q9NRY4 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ARHGAP35Q9NRY4 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ARHGAP35Q9NRY4 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARHGAP35Q9NRY4 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARHGAP35Q9NRY4 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARHGAP35Q9NRY4 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARHGAP35Q9NRY4 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARHGAP35Q9NRY4 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARHGAP35Q9NRY4 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARHGAP35Q9NRY4 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARHGAP35Q9NRY4 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARHGAP35Q9NRY4 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARHGAP35Q9NRY4 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARHGAP35Q9NRY4 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARHGAP35Q9NRY4 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARHGAP35Q9NRY4 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARHGAP35Q9NRY4 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARHGAP35Q9NRY4 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARHGAP35Q9NRY4 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARHGAP35Q9NRY4 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ARHGAP35Q9NRY4 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ARHGAP35Q9NRY4 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ARHGAP35Q9NRY4 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARHGAP35Q9NRY4 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARHGAP35Q9NRY4 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARHGAP35Q9NRY4 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ARHGAP35Q9NRY4 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARHGAP35Q9NRY4 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARHGAP35Q9NRY4 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARHGAP35Q9NRY4 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARHGAP35Q9NRY4 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARHGAP35Q9NRY4 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARHGAP35Q9NRY4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARHGAP35Q9NRY4 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARHGAP35Q9NRY4 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARHGAP35Q9NRY4 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARHGAP35Q9NRY4 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARHGAP35Q9NRY4 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARHGAP35Q9NRY4 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARHGAP35Q9NRY4 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARHGAP35Q9NRY4 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
ARHGAP35Q9NRY4 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARHGAP35Q9NRY4 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARHGAP35Q9NRY4 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARHGAP35Q9NRY4 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
ARHGAP35Q9NRY4 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARHGAP35Q9NRY4 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARHGAP35Q9NRY4 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARHGAP35Q9NRY4 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARHGAP35Q9NRY4 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARHGAP35Q9NRY4 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARHGAP35Q9NRY4 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARHGAP35Q9NRY4 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARHGAP35Q9NRY4 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARHGAP35Q9NRY4 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARHGAP35Q9NRY4 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARHGAP35Q9NRY4 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARHGAP35Q9NRY4 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARHGAP35Q9NRY4 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARHGAP35Q9NRY4 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARHGAP35Q9NRY4 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARHGAP35Q9NRY4 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARHGAP35Q9NRY4 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARHGAP35Q9NRY4 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARHGAP35Q9NRY4 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARHGAP35Q9NRY4 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARHGAP35Q9NRY4 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARHGAP35Q9NRY4 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARHGAP35Q9NRY4 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
ARHGAP35Q9NRY4 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARHGAP35Q9NRY4 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARHGAP35Q9NRY4 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARHGAP35Q9NRY4 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARHGAP35Q9NRY4 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARHGAP35Q9NRY4 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARHGAP35Q9NRY4 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARHGAP35Q9NRY4 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms