Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCN4

GPN1, GPN-loop GTPase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN1Q9HCN4 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GPN1Q9HCN4 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms