Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms