Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBH1

PDF, Peptide deformylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDFQ9HBH1 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDFQ9HBH1 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDFQ9HBH1 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PDFQ9HBH1 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDFQ9HBH1 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDFQ9HBH1 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
PDFQ9HBH1 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PDFQ9HBH1 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PDFQ9HBH1 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PDFQ9HBH1 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PDFQ9HBH1 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PDFQ9HBH1 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PDFQ9HBH1 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDFQ9HBH1 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDFQ9HBH1 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDFQ9HBH1 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDFQ9HBH1 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDFQ9HBH1 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDFQ9HBH1 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDFQ9HBH1 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDFQ9HBH1 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDFQ9HBH1 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDFQ9HBH1 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDFQ9HBH1 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDFQ9HBH1 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDFQ9HBH1 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDFQ9HBH1 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDFQ9HBH1 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDFQ9HBH1 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDFQ9HBH1 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDFQ9HBH1 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDFQ9HBH1 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDFQ9HBH1 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDFQ9HBH1 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDFQ9HBH1 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDFQ9HBH1 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDFQ9HBH1 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDFQ9HBH1 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDFQ9HBH1 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDFQ9HBH1 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDFQ9HBH1 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDFQ9HBH1 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDFQ9HBH1 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDFQ9HBH1 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDFQ9HBH1 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDFQ9HBH1 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDFQ9HBH1 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PDFQ9HBH1 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDFQ9HBH1 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDFQ9HBH1 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDFQ9HBH1 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDFQ9HBH1 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDFQ9HBH1 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PDFQ9HBH1 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDFQ9HBH1 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDFQ9HBH1 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PDFQ9HBH1 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDFQ9HBH1 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDFQ9HBH1 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDFQ9HBH1 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDFQ9HBH1 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDFQ9HBH1 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDFQ9HBH1 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDFQ9HBH1 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDFQ9HBH1 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDFQ9HBH1 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDFQ9HBH1 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDFQ9HBH1 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDFQ9HBH1 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDFQ9HBH1 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDFQ9HBH1 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDFQ9HBH1 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDFQ9HBH1 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDFQ9HBH1 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDFQ9HBH1 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDFQ9HBH1 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDFQ9HBH1 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDFQ9HBH1 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDFQ9HBH1 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDFQ9HBH1 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDFQ9HBH1 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDFQ9HBH1 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDFQ9HBH1 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDFQ9HBH1 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDFQ9HBH1 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDFQ9HBH1 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDFQ9HBH1 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDFQ9HBH1 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDFQ9HBH1 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDFQ9HBH1 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDFQ9HBH1 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDFQ9HBH1 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDFQ9HBH1 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDFQ9HBH1 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDFQ9HBH1 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDFQ9HBH1 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDFQ9HBH1 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDFQ9HBH1 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDFQ9HBH1 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDFQ9HBH1 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms