Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B9

ZCCHC2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC2Q9C0B9 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZCCHC2Q9C0B9 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZCCHC2Q9C0B9 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZCCHC2Q9C0B9 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZCCHC2Q9C0B9 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZCCHC2Q9C0B9 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ZCCHC2Q9C0B9 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ZCCHC2Q9C0B9 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZCCHC2Q9C0B9 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZCCHC2Q9C0B9 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZCCHC2Q9C0B9 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZCCHC2Q9C0B9 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZCCHC2Q9C0B9 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZCCHC2Q9C0B9 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZCCHC2Q9C0B9 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZCCHC2Q9C0B9 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZCCHC2Q9C0B9 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZCCHC2Q9C0B9 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZCCHC2Q9C0B9 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZCCHC2Q9C0B9 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ZCCHC2Q9C0B9 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZCCHC2Q9C0B9 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZCCHC2Q9C0B9 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZCCHC2Q9C0B9 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZCCHC2Q9C0B9 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZCCHC2Q9C0B9 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZCCHC2Q9C0B9 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZCCHC2Q9C0B9 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZCCHC2Q9C0B9 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZCCHC2Q9C0B9 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZCCHC2Q9C0B9 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZCCHC2Q9C0B9 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZCCHC2Q9C0B9 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZCCHC2Q9C0B9 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZCCHC2Q9C0B9 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZCCHC2Q9C0B9 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZCCHC2Q9C0B9 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZCCHC2Q9C0B9 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZCCHC2Q9C0B9 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZCCHC2Q9C0B9 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZCCHC2Q9C0B9 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZCCHC2Q9C0B9 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZCCHC2Q9C0B9 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZCCHC2Q9C0B9 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZCCHC2Q9C0B9 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZCCHC2Q9C0B9 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZCCHC2Q9C0B9 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZCCHC2Q9C0B9 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms