Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms