Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HIRIP3Q9BW71 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HIRIP3Q9BW71 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HIRIP3Q9BW71 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HIRIP3Q9BW71 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HIRIP3Q9BW71 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HIRIP3Q9BW71 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HIRIP3Q9BW71 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
HIRIP3Q9BW71 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
HIRIP3Q9BW71 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HIRIP3Q9BW71 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HIRIP3Q9BW71 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HIRIP3Q9BW71 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HIRIP3Q9BW71 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
HIRIP3Q9BW71 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HIRIP3Q9BW71 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HIRIP3Q9BW71 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HIRIP3Q9BW71 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HIRIP3Q9BW71 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HIRIP3Q9BW71 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
HIRIP3Q9BW71 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HIRIP3Q9BW71 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HIRIP3Q9BW71 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HIRIP3Q9BW71 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HIRIP3Q9BW71 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HIRIP3Q9BW71 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HIRIP3Q9BW71 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HIRIP3Q9BW71 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms