Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY5

CRAMP1, Protein cramped-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRAMP1Q96RY5 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms