Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC9Q96Q05 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms