Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG6

VPS50, Syndetin, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS50Q96JG6 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VPS50Q96JG6 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VPS50Q96JG6 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.7 ms