Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms