Protein–RNA interactions for Protein: Q96ER9

CCDC51, Coiled-coil domain-containing protein 51, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC51Q96ER9 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC51Q96ER9 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC51Q96ER9 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC51Q96ER9 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC51Q96ER9 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC51Q96ER9 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC51Q96ER9 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC51Q96ER9 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC51Q96ER9 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC51Q96ER9 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC51Q96ER9 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC51Q96ER9 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC51Q96ER9 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC51Q96ER9 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC51Q96ER9 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC51Q96ER9 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC51Q96ER9 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC51Q96ER9 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC51Q96ER9 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC51Q96ER9 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC51Q96ER9 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC51Q96ER9 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC51Q96ER9 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC51Q96ER9 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC51Q96ER9 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC51Q96ER9 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC51Q96ER9 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC51Q96ER9 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC51Q96ER9 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC51Q96ER9 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC51Q96ER9 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC51Q96ER9 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC51Q96ER9 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC51Q96ER9 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC51Q96ER9 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC51Q96ER9 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC51Q96ER9 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC51Q96ER9 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC51Q96ER9 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC51Q96ER9 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC51Q96ER9 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC51Q96ER9 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC51Q96ER9 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC51Q96ER9 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC51Q96ER9 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC51Q96ER9 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC51Q96ER9 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC51Q96ER9 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC51Q96ER9 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC51Q96ER9 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC51Q96ER9 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC51Q96ER9 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC51Q96ER9 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC51Q96ER9 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC51Q96ER9 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC51Q96ER9 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC51Q96ER9 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC51Q96ER9 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC51Q96ER9 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC51Q96ER9 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC51Q96ER9 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC51Q96ER9 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC51Q96ER9 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC51Q96ER9 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC51Q96ER9 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC51Q96ER9 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC51Q96ER9 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC51Q96ER9 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC51Q96ER9 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC51Q96ER9 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC51Q96ER9 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC51Q96ER9 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC51Q96ER9 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC51Q96ER9 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC51Q96ER9 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC51Q96ER9 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms