Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MALSU1Q96EH3 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms