Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms