Protein–RNA interactions for Protein: Q96C24

SYTL4, Synaptotagmin-like protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL4Q96C24 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYTL4Q96C24 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms