Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms