Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF3AQ92664 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms