Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms