Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV41

SNX33, Sorting nexin-33, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX33Q8WV41 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNX33Q8WV41 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms