Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCT1

ARRDC4, Arrestin domain-containing protein 4, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC4Q8NCT1 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARRDC4Q8NCT1 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARRDC4Q8NCT1 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARRDC4Q8NCT1 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARRDC4Q8NCT1 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ARRDC4Q8NCT1 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ARRDC4Q8NCT1 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARRDC4Q8NCT1 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARRDC4Q8NCT1 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARRDC4Q8NCT1 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARRDC4Q8NCT1 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARRDC4Q8NCT1 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARRDC4Q8NCT1 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARRDC4Q8NCT1 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARRDC4Q8NCT1 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARRDC4Q8NCT1 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARRDC4Q8NCT1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARRDC4Q8NCT1 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ARRDC4Q8NCT1 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARRDC4Q8NCT1 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARRDC4Q8NCT1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARRDC4Q8NCT1 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARRDC4Q8NCT1 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARRDC4Q8NCT1 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARRDC4Q8NCT1 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARRDC4Q8NCT1 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARRDC4Q8NCT1 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARRDC4Q8NCT1 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARRDC4Q8NCT1 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ARRDC4Q8NCT1 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARRDC4Q8NCT1 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARRDC4Q8NCT1 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARRDC4Q8NCT1 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARRDC4Q8NCT1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARRDC4Q8NCT1 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARRDC4Q8NCT1 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ARRDC4Q8NCT1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARRDC4Q8NCT1 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARRDC4Q8NCT1 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARRDC4Q8NCT1 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARRDC4Q8NCT1 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARRDC4Q8NCT1 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARRDC4Q8NCT1 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARRDC4Q8NCT1 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARRDC4Q8NCT1 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARRDC4Q8NCT1 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARRDC4Q8NCT1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARRDC4Q8NCT1 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARRDC4Q8NCT1 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARRDC4Q8NCT1 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARRDC4Q8NCT1 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARRDC4Q8NCT1 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARRDC4Q8NCT1 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARRDC4Q8NCT1 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARRDC4Q8NCT1 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARRDC4Q8NCT1 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARRDC4Q8NCT1 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARRDC4Q8NCT1 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARRDC4Q8NCT1 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARRDC4Q8NCT1 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARRDC4Q8NCT1 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ARRDC4Q8NCT1 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARRDC4Q8NCT1 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARRDC4Q8NCT1 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ARRDC4Q8NCT1 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARRDC4Q8NCT1 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARRDC4Q8NCT1 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARRDC4Q8NCT1 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARRDC4Q8NCT1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARRDC4Q8NCT1 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARRDC4Q8NCT1 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARRDC4Q8NCT1 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARRDC4Q8NCT1 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARRDC4Q8NCT1 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARRDC4Q8NCT1 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARRDC4Q8NCT1 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARRDC4Q8NCT1 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARRDC4Q8NCT1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARRDC4Q8NCT1 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARRDC4Q8NCT1 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARRDC4Q8NCT1 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARRDC4Q8NCT1 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARRDC4Q8NCT1 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARRDC4Q8NCT1 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARRDC4Q8NCT1 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARRDC4Q8NCT1 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARRDC4Q8NCT1 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARRDC4Q8NCT1 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ARRDC4Q8NCT1 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARRDC4Q8NCT1 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARRDC4Q8NCT1 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ARRDC4Q8NCT1 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARRDC4Q8NCT1 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARRDC4Q8NCT1 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARRDC4Q8NCT1 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARRDC4Q8NCT1 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARRDC4Q8NCT1 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARRDC4Q8NCT1 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARRDC4Q8NCT1 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARRDC4Q8NCT1 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
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