Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FAM71DQ8N9W8 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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FAM71DQ8N9W8 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM71DQ8N9W8 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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FAM71DQ8N9W8 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM71DQ8N9W8 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM71DQ8N9W8 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM71DQ8N9W8 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM71DQ8N9W8 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM71DQ8N9W8 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM71DQ8N9W8 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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