Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W5

DNAAF3, Dynein assembly factor 3, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF3Q8N9W5 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DNAAF3Q8N9W5 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DNAAF3Q8N9W5 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms