Protein–RNA interactions for Protein: Q86YD3

TMEM25, Transmembrane protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM25Q86YD3 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM25Q86YD3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM25Q86YD3 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM25Q86YD3 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM25Q86YD3 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM25Q86YD3 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM25Q86YD3 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM25Q86YD3 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM25Q86YD3 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM25Q86YD3 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM25Q86YD3 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM25Q86YD3 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM25Q86YD3 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM25Q86YD3 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM25Q86YD3 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM25Q86YD3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM25Q86YD3 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM25Q86YD3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM25Q86YD3 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM25Q86YD3 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM25Q86YD3 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM25Q86YD3 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM25Q86YD3 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM25Q86YD3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM25Q86YD3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM25Q86YD3 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM25Q86YD3 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM25Q86YD3 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM25Q86YD3 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM25Q86YD3 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM25Q86YD3 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM25Q86YD3 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM25Q86YD3 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM25Q86YD3 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM25Q86YD3 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM25Q86YD3 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM25Q86YD3 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM25Q86YD3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM25Q86YD3 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM25Q86YD3 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM25Q86YD3 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM25Q86YD3 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM25Q86YD3 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM25Q86YD3 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM25Q86YD3 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM25Q86YD3 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM25Q86YD3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM25Q86YD3 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM25Q86YD3 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM25Q86YD3 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM25Q86YD3 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM25Q86YD3 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM25Q86YD3 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM25Q86YD3 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM25Q86YD3 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM25Q86YD3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM25Q86YD3 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM25Q86YD3 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM25Q86YD3 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM25Q86YD3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM25Q86YD3 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM25Q86YD3 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM25Q86YD3 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM25Q86YD3 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM25Q86YD3 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM25Q86YD3 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM25Q86YD3 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM25Q86YD3 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM25Q86YD3 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM25Q86YD3 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM25Q86YD3 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM25Q86YD3 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM25Q86YD3 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM25Q86YD3 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM25Q86YD3 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM25Q86YD3 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM25Q86YD3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM25Q86YD3 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TMEM25Q86YD3 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TMEM25Q86YD3 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TMEM25Q86YD3 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TMEM25Q86YD3 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM25Q86YD3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM25Q86YD3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM25Q86YD3 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM25Q86YD3 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM25Q86YD3 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM25Q86YD3 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM25Q86YD3 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM25Q86YD3 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM25Q86YD3 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM25Q86YD3 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM25Q86YD3 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM25Q86YD3 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM25Q86YD3 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM25Q86YD3 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM25Q86YD3 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM25Q86YD3 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM25Q86YD3 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM25Q86YD3 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms