Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7K0

CMC1, COX assembly mitochondrial protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC1Q7Z7K0 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CMC1Q7Z7K0 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CMC1Q7Z7K0 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CMC1Q7Z7K0 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CMC1Q7Z7K0 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CMC1Q7Z7K0 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CMC1Q7Z7K0 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CMC1Q7Z7K0 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CMC1Q7Z7K0 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CMC1Q7Z7K0 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CMC1Q7Z7K0 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CMC1Q7Z7K0 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CMC1Q7Z7K0 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CMC1Q7Z7K0 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CMC1Q7Z7K0 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CMC1Q7Z7K0 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CMC1Q7Z7K0 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CMC1Q7Z7K0 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CMC1Q7Z7K0 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CMC1Q7Z7K0 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CMC1Q7Z7K0 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CMC1Q7Z7K0 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CMC1Q7Z7K0 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CMC1Q7Z7K0 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CMC1Q7Z7K0 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CMC1Q7Z7K0 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CMC1Q7Z7K0 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CMC1Q7Z7K0 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CMC1Q7Z7K0 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CMC1Q7Z7K0 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CMC1Q7Z7K0 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CMC1Q7Z7K0 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CMC1Q7Z7K0 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CMC1Q7Z7K0 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CMC1Q7Z7K0 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CMC1Q7Z7K0 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CMC1Q7Z7K0 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CMC1Q7Z7K0 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CMC1Q7Z7K0 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CMC1Q7Z7K0 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CMC1Q7Z7K0 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CMC1Q7Z7K0 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CMC1Q7Z7K0 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CMC1Q7Z7K0 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CMC1Q7Z7K0 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CMC1Q7Z7K0 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CMC1Q7Z7K0 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CMC1Q7Z7K0 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CMC1Q7Z7K0 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CMC1Q7Z7K0 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CMC1Q7Z7K0 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CMC1Q7Z7K0 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CMC1Q7Z7K0 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CMC1Q7Z7K0 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CMC1Q7Z7K0 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CMC1Q7Z7K0 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CMC1Q7Z7K0 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CMC1Q7Z7K0 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CMC1Q7Z7K0 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CMC1Q7Z7K0 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CMC1Q7Z7K0 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CMC1Q7Z7K0 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CMC1Q7Z7K0 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CMC1Q7Z7K0 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CMC1Q7Z7K0 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CMC1Q7Z7K0 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CMC1Q7Z7K0 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CMC1Q7Z7K0 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CMC1Q7Z7K0 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CMC1Q7Z7K0 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CMC1Q7Z7K0 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CMC1Q7Z7K0 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CMC1Q7Z7K0 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CMC1Q7Z7K0 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CMC1Q7Z7K0 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CMC1Q7Z7K0 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CMC1Q7Z7K0 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CMC1Q7Z7K0 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CMC1Q7Z7K0 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CMC1Q7Z7K0 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CMC1Q7Z7K0 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CMC1Q7Z7K0 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CMC1Q7Z7K0 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CMC1Q7Z7K0 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CMC1Q7Z7K0 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CMC1Q7Z7K0 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CMC1Q7Z7K0 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms