Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHLHA9Q7RTU4 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms