Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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