Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC9Q6ZRR7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms