Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms