Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSSK4Q6SA08 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms