Protein–RNA interactions for Protein: Q6RVD6

SPATA8, Spermatogenesis-associated protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA8Q6RVD6 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC8.98□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC8.98□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC8.98□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC8.98□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
SPATA8Q6RVD6 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms