Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ6

FBXO38, F-box only protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO38Q6PIJ6 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FBXO38Q6PIJ6 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms