Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USPL1Q5W0Q7 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms