Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P6

TMEM78, Transmembrane protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM78Q5T7P6 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TMEM78Q5T7P6 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms