Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC93Q567U6 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.7 ms