Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI63

KRTAP20-1, Keratin-associated protein 20-1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-1Q3LI63 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 AC022121.1-201ENST00000484584 579 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 HCG18-241ENST00000602290 821 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP20-1Q3LI63 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms