Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
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