Protein–RNA interactions for Protein: Q16778

HIST2H2BE, Histone H2B type 2-E, humanhuman

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2BEQ16778 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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HIST2H2BEQ16778 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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HIST2H2BEQ16778 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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HIST2H2BEQ16778 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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HIST2H2BEQ16778 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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HIST2H2BEQ16778 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST2H2BEQ16778 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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