Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF239Q16600 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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