Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
VAMP3Q15836 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VAMP3Q15836 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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