Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TAF1AQ15573 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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