Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TLR1Q15399 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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