Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
NECTIN1Q15223 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NECTIN1Q15223 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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