Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
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