Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
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