Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
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GBX1Q14549 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GBX1Q14549 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GBX1Q14549 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GBX1Q14549 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GBX1Q14549 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GBX1Q14549 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GBX1Q14549 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
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GBX1Q14549 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GBX1Q14549 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GBX1Q14549 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GBX1Q14549 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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GBX1Q14549 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GBX1Q14549 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GBX1Q14549 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GBX1Q14549 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GBX1Q14549 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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GBX1Q14549 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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GBX1Q14549 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GBX1Q14549 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GBX1Q14549 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GBX1Q14549 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GBX1Q14549 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GBX1Q14549 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GBX1Q14549 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GBX1Q14549 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GBX1Q14549 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GBX1Q14549 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GBX1Q14549 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GBX1Q14549 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GBX1Q14549 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GBX1Q14549 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GBX1Q14549 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GBX1Q14549 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GBX1Q14549 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GBX1Q14549 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GBX1Q14549 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GBX1Q14549 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GBX1Q14549 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GBX1Q14549 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
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