Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSHL1Q14406 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms