Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms